1. Thực thi mạng LAN không dây chuẩn công nghiệp với độ trễ thấp và đồng bộ thời gian chính xác cao cho công nghiệp 5.0, 2022
2. Đánh giá chất lượng kỹ thuật đa truy cập phi trực giao cho truyền thông không dây MIMO, 2019-2021
3. Nghiên cứu và ứng dụng mã hóa mạng trong việc nâng cao chất lượng truyền nhận dữ liệu trong mạng tổn hao, 2018-2020
4. Xây dựng thuật toán cảm biến phổ tần trên phần mềm và phần cứng ứng dụng cho vô tuyến nhận thức, 2015-2018
5. Phân tích và thiết kế các ảnh hưởng kênh truyền đến chất lượng hệ thống truyền thông không dây thế hệ mới trên FPGA, 2014-2017
6. Nghiên cứu và đánh giá chất lượng hệ thống MIMO, 2010-2014
7. PGS.TS. Nguyễn Đình Thúc và TS. Huỳnh Hữu Thuận, đề tài cấp nhà nước, KC.01.TN16/11-15, “Thiết kế và hiện thực một số lõi IP chuyên dụng cho các hệ mã công khai và mã dòng thực hiện trên FPGA”, nghiệm thu năm 2014.
8. TS. Huỳnh Hữu Thuận và PGS. Vũ Hải Quân, đề tài trọng điểm ĐHQG “Thiết kế hệ thống nhúng trên FPGA và vi mạch Synthesizer dùng trong TTS tiếng Việt”, nghiệm thu năm 2015
9. PGS. TS. Nguyễn Đình Thúc và TS. Huỳnh Hữu Thuận, đề tài trọng điểm ĐHQG, “Nghiên cứu thiết kế và hiện thực một số lõi IP chuyên dụng cho mã hóa/giải mã thực hiện trên FPGA”, nghiện thu năm 2015
10. TS. Huỳnh Hữu Thuận và PGS. TS. Nguyễn Đình Thúc, đề tài Sở KH&CN TP.HCM, “Nghiên cứu xây dựng giải thuật mã hóa – mật mã (RSA và ZUC) dùng trong việc truyền dữ liệu video và cài đặt phần cứng chuyên dụng phục vụ cho các ứng dụng về an ninh thông tin”, nghiệm thu năm 2015
11. TS. Huỳnh Hữu Thuận và PGS. TS. Nguyễn Đình Thúc, đề tài Sở KH&CN TP.HCM, “Thiết kế vi mạch dùng SoC FPGA cho các ứng dụng IoT có tính bảo mật cao”, đang thực hiện